گروه مهندسی کشاورزی در سال 1376 با رشته علوم باغبانی در مقطع کارشناسی راه اندازی شد. این گروه در حال حاضر دارای 6 گرایش مقطع  کارشناسی ارشد و2  گرایش  مقطع دکتری  در رشته علوم ومهندسی  باغبانی  و یک گرایش در مقطع کارشناسی ارشد در رشته علوم و مهندسی آب  می باشد. امروزه این گروه میزبان بیش از 140 دانشجوی تحصیلات تکمیلی و 11 عضو هیات علمی تمام وقت است. این گروه علاوه بر ارائه آزمایشگاه‌های آموزشی و امکانات تکمیلی دروس، دارای بیش از 4 آزمایشگاه تحقیقاتی بسیار تخصصی (فیزیولوژی،-بیوتکنولوژی،-کشت بافت و گیاهان دارویی) و 3 واحد گلخانه‌ای و نهالستان گیاهی به مدیریت اعضای محترم هیأت علمی است.
فعالیت های تحقیقاتی در بخش کشاورزی شامل موارد مختلفی بوده که در دسته های زیر قرار می گیرند:

• فیزیولوژی گیاهی
• تنش های زنده و غیر زنده (خشکی، شوری، دما و ...)
• اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی
• کشاورزی پایدار
• تولید گیاهان گرمسیری و نیمه گرمسیری
• فیزیولوژی پس از برداشت

در  گروه  مهندسی کشاورزی  تعداد  11 نفر  اعضای هیأت علمی حضور دارند و تعداد 142 دانشجو به تفکیک 116  دانشجو در مقطع کارشناسی  ارشد و 26 دانشجو در مقطع  دکترا مشغول به  تحصیل می باشند.